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随着新玉米的上市和饲料中的新玉米的大量使用，往往会出现以下问题：如饲料霉变（特别要注意母猪料）；畜禽采食量大；猪适口性差；畜禽发生拉稀（软便）、腹泻（新玉米酸度大、抗性淀粉含量高）；饲料转化率低等（生长速度慢）。
这主要是由于新玉米收获后，但并不等于完全成熟，还有一个后熟化过程；新玉米中含有一种不易被消化的抗性淀粉，是不易被猪消化吸收的，所以营养价值要低于陈旧玉米。抗性淀粉作为一种新型膳食纤维在食品中研究较多，由于不消化不吸收，不会给人体增加热量，可增加饱腹感，减少能量摄入，有利于减轻体重、促进脂肪氧化、增加脂肪排出对人体减轻体重有益；但对于动物生产却造成负面影响，因此可能会不同程度地出现软便、腹泻、饲料报酬高等症状，每年冬季发现育肥猪采食量大但生长速度并不快，而且脱肛较多，往往和新玉米有关系。
玉米是后熟生理作物，新玉米中的抗性淀粉含量最高，贮存5——6周后，含量逐渐降低。熟化期与玉米的收割时间有关系：收割时如果只有玉米的下部叶子发黄，后熟化过程需要40——60天，如果玉米秸秆基本干黄了，后熟化过程大概在15——20天。
新玉米往往水分较高，玉米水分多一个点，能量蛋白比相差0.5%,能量赖氨酸比相差0.5%，也就相当于营养价值相差0.5%。而且高水分会破坏日粮中维生素等活性成分、降低日粮中代谢能水平和粗蛋白水平、打破日粮中各营养素间的平衡关系等。
养殖户认为玉米霉变只发生在玉米贮存过程中，但实际上引起玉米发霉的霉菌分为仓储霉菌和田间霉菌。霉菌的潜在性及霉菌毒素的存在给饲料质量带来隐患，添加霉菌毒素吸附剂固然是个办法，但关键还是高度重视霉菌污染的问题，把生霉粒控制在1%范围内。
新玉米使用时需要注意以下几点：
将新玉米适度陈化，时间需要1个月以上。
使用新玉米时可以与高品质的陈玉米逐步混用过渡，过渡期半个月以上。
新玉米配料时要保证3天用完否侧容易影响品质（饲料发热）破坏营养成分。